“基因调控+”植物盐碱抗性分子机制研究(国家级大创)——负责人、优秀项目 2022.10–2023.10- 利用植物的转录组数据,对其进行分析并克隆出过氧化物酶基因,通过对该基因家族的基因表达特异性研究方法,最终评定出能解析四百个 CAT 在植株盐胁迫下的耐盐调控通路,构建出能用于百个适应碱性盐胁迫的分子调控网络。
- 本人负责实验设计实施、数据分析、成果发表、项目答辩工作,掌握实验设计方法、转录组数据分析方法、引物设计方法、表达载体的构建及转化、RT-PCR 分析、酵母双杂实验。
- 项目成果:
北核论文,第一作者:与 siPHB3 相互作用蛋白的功能验证和筛选,***期刊
- 实用新型专利,第一发明人:一种蛋白筛选装置,专利号:ZL 2023 2 *****X
- 软件著作权,第一署名著作人:基于植物的转录组数据分析软件,登记号:2023*****R
花生四烯酸代谢相关基因的分析(中科院所)——生信项目、独立完成 2023.10–2024.4- 采用 bulk RNA-seq 和 scRNA-seq 数据对枢纽基因和 OA 前驱的 IME 进行整合分析,最终发现 OA 滑膜中 AMP 相关基因表达上调,并鉴定出 7 个枢纽基因(Irc4、PTGS2、PTGS1、MAPKAPK2、CBR1、PTGDS 和 CYP2U1)。此外,还发现 hub 基因表达、免疫细胞内炎性炎症细胞因子水平之间存在显著相关性,为骨性关节炎的提供新的潜在诊断标志。
- 本人负责并熟练掌握机器学习算法(SVR-RFE 算法)在基因的重要性排序方法、DCA 分析、共表达网络的建立,熟练掌握 NCBI、IQtrees(phylogenetic tree)、MEGA X(alignment & phylogenetic tree)、R 等软件和网站的使用。
- ▶ 项目成果:
SCI(Miner revisions),第一作者:Comprehensive analysis of arachidonic acid metabolism-related genes in diagnosis and synovial immune in osteoarthritis: based on bulk and single-cell RNA sequencing data
“挑战杯”全国大学生课外科术科技作品竞赛 金奖 2023年11月
美国大学生数学建模比赛
2 M奖 2023年5月
全国大学生英语竞赛 二等奖 2023年12月
其他科研技能:熟练掌握 PPT、PS 及 AI 科研绘图;掌握转录组数据分析;掌握 EndNote 文献管理;熟练掌握英文文献检索;掌握基本的 C 语言、Python 语言代码、Linux 系统、MATLAB 操作;掌握基本的生物信息学分析方法;掌握英文论文投稿;掌握基础生化、细胞、遗传、生理、分子、物化理论知识及实验技能。